在马来西亚，航空的主要基地是首都的吉隆坡国际机场。它的二级枢纽机场则是在哥打京那巴鲁。
马来西亚航空公司在中东，东亚，南亚，东南亚还有欧洲和大洋洲豆保持拥有者强大的市场竞争力。马来西亚航空公司还运营跨大西洋航班从吉隆坡到纽瓦克，和从吉隆坡经斯德哥尔摩中转到洛杉矶航线。
自1997年开始，马来西亚航空公司就拥用世界上最长的非商业航线，由波音公司西雅图公司向东飞向经过欧洲和非洲大陆，最后到达吉隆坡，打破了马来西亚的中途不降落最长飞行记录，飞行的客机是波音777 - 200LR飞机。
除正常营运外，马来西亚航空公司还有着其它的收入来源，包括维护保养，修理、大修（MRO）和飞机处理。马来西亚航空公司有两个航空子公司：萤火虫和MASWings 。萤火虫所经营的是定期航班，总部设在槟城国际机场，将营运对象重点放在有高等教育的城市，MASWings则往返于婆罗洲之间航班。
此外，马来西亚航空公司的货机机队也具备着较强的实力。 MASCharter是马来西亚航空公司的子公司，经营包机服务。
自成立以来在1963年后，马来亚航空公司是分成两个部分，马来西亚航空公司已建立了良好的品牌在航空业的服务和安全性 ，再加上多次获奖（如权威的国际机构Skytrax评出的最佳航空公司）。目前为止只有6家航空公司将获得由Skytrax 评出的5星级航空公司，马来西亚航空就是其中一家（其他5家是韩亚航空，国泰航空，卡塔尔航空，新加坡航空，翠鸟航空）。
马来西亚航空公司的母公司是持有它69.34%股权的马来西亚飞行公司(PMB)。飞萤航空公司(FlyFirefly Sdn Bhd)，则是马来西亚航空公司独资拥有的子公司。
